Ген интерлейкина 28B, II класс цитокиновых рецепторов (IL28B). Выявление мутации g.39738787C>T (rs12979860, регуляторная область гена)
Название гена - IL28B
Локализация гена на хромосоме - 19q13.2
Встречаемость в популяции
Встречаемость минорного (Т) аллеля в европейской популяции составляет 32 %.
Ассоциация маркера с заболеваниями
Маркер связан с генетической резистентностью к вирусным инфекциям и эффективностью лечения хронического гепатита С препаратами рибавирин ("Ребетол") и PEG-интерферон ("ПегИнтрон"). Полиморфизм IL28B определяет как вероятность самопроизвольной элиминации вируса, так и ответ на противовирусную терапию. Анализ назначается:
Общая информация об исследовании
Вирус гепатита С в основном передается через кровь. Им поражено около 3 % населения мира. Инфекция вызывает острый гепатит и характеризуется отсутствием достаточного иммунного ответа. В 50-80 % случаев он переходит в хроническую форму и приводит к циррозу печени и гепатоцеллюлярной карциноме.
В настоящее время в качестве противовирусной терапии (ПВТ) гепатита С наиболее часто применяется сочетание двух препаратов – интерферона-альфа ("PEG-интерферона") и рибавирина, что подтверждается международными исследованиями и клинической практикой.
Основной задачей противовирусной терапии является профилактика цирроза печени и гепатокарциномы. Курс лечения хронического вирусного гепатита С продолжается 16-72 недели. При таком длительном применении данных препаратов развивается ряд выраженных побочных эффектов, так что в некоторых случаях лечение приходится прекратить. Эффективность противовирусной терапии зависит от многих факторов: генотипа вируса, исходной вирусной нагрузки, длительности инфицирования, обмена железа в организме, активности трансаминаз, избыточной массы тела, стеатоза печени, инсулинорезистентности, возраста, пола, алкогольной и наркотической зависимости, сопутствующих заболеваний, наличия выраженного фиброза.
Достижение устойчивого вирусологического ответа, а также определение риска побочных реакций при приеме противовирусных препаратов очень важны для больного. В последнее время, чтобы оценить эффективность начальной или повторной ПВТ, используют индивидуальный генетический фактор – статус гена IL28B . Наибольшее диагностическое значение он имеет при лечении ХГС, вызванного 1-м генотипом вируса. При ХГС, вызванном 2-м и 3-м генотипами вируса, полиморфизм гена IL28B значим только для пациентов, у которых не достигнут быстрый вирусологический ответ (отсутствие РНК вируса гепатита С на 4-й неделе лечения).
Распределение генотипов IL28B отличается в различных популяциях по всему миру и объясняет разную эффективность противовирусной терапии PEG-интерфероном и рибавирином в этнических группах.
При выявлении у пациента генотипа СС наблюдается:
Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции.
Для пациентов с генотипами С/Т и Т/Т характерно снижение вероятности ответа на ПВТ, т. е. низкая эффективность лечения.
ГЕПАТИТ С - инфекционное заболевание, которое у хронически инфицированных пациентов связано с риском развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Вирус гепатита С (HCV) имеет несколько генотипов, из них наиболее часто в нашей стране встречается вирус гепатита С генотипа 1.
Современная противовирусная терапия хронического гепатита С представляет собой комбинированную терапию пегилированным интерфероном (интерферон с добавленной молекулой полиэтиленгликоля и удлиненным эффектом) и рибавирином (PEG-IFN/RBV, ПЕГ ИФН/РИБ) и позволяет добиться успеха (устойчивого вирусологического ответа) у 40-60% пациентов.
Очевидно, что выявление факторов, влияющих на успех лечения, в том числе генетических, имеет большое значение, как для врача, которому необходимы объективные критерии прогноза эффективности лечения, так и для пациента, который перед началом проведения стандартной терапии должен быть информирован о вероятности ее успеха и побочном действии используемых противовирусных препаратов.
Генетические варианты, связанные с функциями определенных цитокинов, влияют на индивидуальные особенности иммунного ответа на данную инфекцию. IL28B представляет собой интерферон-λ-3 и является лигандом цитокинового рецептора II класса. Эти лиганды запускают JAK/STAT сигнальный каскад, активируя синтез 2’,5’-олигоаденилат-синтетазы, который активирует эндо-нуклеазу. Эндонуклеаза, в свою очередь, участвует в процессах стимуляции образования фермента протеинкиназы, который блокирует синтез вирусных белков.
Показано, что полиморфизмы, ассоциированные с геном IL28B, связаны с вероятностью самопроизвольной элиминации HCV и ответа на противовирусную терапию. Основную роль играют две замены: замена цитозина на тимин (C>T) в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860 и замена тимина на гуанин (T>G) в однонуклеотидном полиморфизме rs8099917.
По однонуклеотидному полиморфизму rs12979860 генотип С/С связан с вдвое более высокой вероятностью положительного ответа на лечение интерфероном и рибавирином, в то время как генотипы T/C и T/T в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение. Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции. Иммунная система носителей аллелей С/С более способна самостоятельно побеждать вирус. Интересно, что при генотипе С/С вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей Т/Т.
По однонуклеотидному полиморфизму rs8099917 генотип Т/Т связан со спонтанным разрешением инфекции, независимо от лечения, в то время как генотипы G/T и G/G в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение и достижения устойчивого вирусологического ответа. Аллель G в rs8099917 является аллелем риска и ассоциирован с низким уровнем ответа на терапию пегилированным интерфероном и рибавирином.
Исследования роли генетического полиморфизма указанных участков человеческого генома показали, что положительное предсказательное значение полиморфизма IL28B выше, чем других базовых характеристик, применяемых для прогноза успеха терапии (индекс массы тела, возраст, стадия фиброза и вирусная нагрузка). Однако, в исследованиях на больших популяциях больных хроническим гепатитом с различным клиническим профилем (стадия фиброза печени от 0 до 4, исходный уровень виремии низкий и высокий) было показано, что предсказательное значение генотипа пациента по IL28 для достижения устойчивого вирусологического ответа может существенно модифицироваться в зависимости от клинических характеристик и снижаться с 74,4% до 37,3% для пациентов с генотипом rs12979860 С/С. Поэтому генетические маркеры необходимо учитывать в комплексе с другими базовыми характеристиками конкретного пациента. Показано, что наибольшее значение полиморфизм IL28B имеет при инфицировании 1 субтипом HCV.
Специальной подготовки не требуется.
Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.
Интерпретация результатов
ПОЛИМОРФИЗМ: ГЕН, ЗАМЕНА В ДНК, ОБОЗНАЧЕНИЕ В NCBI | ГЕНОТИП | ВАРИАНТЫ ЗАКЛЮЧЕНИЙ |
С/С | Полиморфизм в гене IL28B: rs12979860 не выявлен. Возможно спонтанное разрешение инфекции. Около 80% пациентов с ХГС отвечают на лечение. Характерна высокая вирусная нагрузка. | |
С/Т | Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs12979860 в гетерозиготной форме. 20-40% пациентов с ХГС отвечают на лечение | |
Т/Т | Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs12979860 в гомозиготной форме. 20-25% пациентов с ХГС отвечают на лечение. | |
Т/Т | Полиморфизм в гене IL28B: rs809991 не выявлен. Возможно спонтанное разрешение инфекции. Около 70% пациентов с ХГС отвечают на лечение. | |
G/T | Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs8099917 в гетерозиготной форме. Сниженный ответ на терапию интерфероном и рибавирином | |
G/G | Выявлен полиморфизм в гене IL28B: rs8099917 в гомозиготной форме. Низкий ответ на терапию интерфероном и рибавирином. |
1. Внутренние болезни по Тинсли Р.Харрисону. Практика 2005. 3388 с.
2. Ghary M.G. et al. Diagnosis, management and treatment of hepatitis C: an update. American Association for the Study of Liver Diseases. Hepatology. 2009, Apr; 49 (4): 1335-1374
3. Thomas D.L. et al. Genetic variation in IL28 B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. Nature. 2009. Vol. 461, № 7265. P. 798–801.
4. Thompson A.J. et al. Interleukin-28 B polymorphism improves viral kinetics and is the strongest pretreatment predictor of sustained virologic response in genotype 1 hepatitis C virus. Gastroenterology. 2010, Jul; 139 (1): 120–129
5. Материалы производителя реагентов.
Интерлейкин-28B (генотипирование) (прогноз лечения ВГС)
Описание анализа:
Интерлейкин-28B (генотипирование) – тест для определения генетических полиморфизмов, ассоциированных с функциями интерлейкина 28B, методом ПЦР (полимеразной цепной реакции).
Определение генотипа пациента по IL28B может изменить алгоритм принятия решения о лечении путем изменения длительности как стандартного курса терапии ПЕГ ИФН/РИБ, так и длительности тройной терапии ХГС. Оптимизация терапии позволит избежать многих дополнительных проблем при лечении пациентов с высокой вероятностью положительного ответа при назначении терапии (избежать дополнительных побочных эффектов и дополнительных затрат на тройную терапию с включением ингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира).
Материал для исследования: цельная кровь.
Подготовка к исследованию: забор крови производится строго натощак (не менее 8 часов после последнего приема пищи).
Интерпретация результата:
Полиморфизм: |
Возможные проявления полиморфизма |
|
Интерлейкин-28B (RS8099917) |
Обнаружен генотип GG |
Низкий ответ на терапию интерфероном и рибавирином |
Обнаружен генотип TG |
Сниженный ответ на терапию интерфероном и рибавирином |
|
Обнаружен генотип TT |
Возможно спонтанное разрешение инфекции |
|
Интерлейкин-28B (RS12979860) |
Обнаружен генотип CC |
1. Возможно спонтанное разрешение инфекции 2. Около 80% пациентов с ХГС отвечают на лечение 3. Характерна высокая вирусная нагрузка |
Обнаружен генотип CT |
20-40% пациентов с ХГС отвечают на лечение |
|
Обнаружен генотип TT |
20-25% пациентов с ХГС отвечают на лечение |
* * Сроки выполнения исследований исчисляются с момента поступления материала в лабораторию, без учета дня забора материала. При доставке из других ЛПУ сроки могут увеличиться за счет времени доставки.
+ Пояснения, по обозначению цвета пробиркиПРИМОРСКИЙ КРАЙ | ||
Владивосток |
Как показали исследования последних лет, особое влияние на результат лечения, а такжевозможность самостоятельного выздоровления при заражении ,оказывают генетические факторы, особенно полиморфизмы гена интерлейкина 28В. Интерлейкин 28В является представителем интерферонов-лямбда, илиинтерферонов 3типа, обладающих сильным противовирусным действием и подавляющих репликациювируса гепатита С. Были изучены полиморфизмы гена интерлейкина 28В, связанные сустойчивым вирусологическим ответом. При определенных генотипах достижениеустойчивого вирусологического ответа достигается в 2 раза чаще.Основную роль при инфицировании гепатитом С играют две однонуклеотидные замены: Замена цитозина на тимин (C>T), имеющая обозначениеrs12979860 в базе данных dbSNPнационального центра биотехнологической информации США (National Center forBiotechnological Information, NCBI). Замена тимина на гуанин (T>G), имеющая обозначение rs8099917 В зависимости от нуклеотидов в этих локусах, выделены аллели C (цитозин), T (тимин), G(гуанин) и соответствующие генотипы: для аллели rs12979860 – СС, СТ, ТТ, а также ТТ, ТG, GGдля аллелей rs8099917.Получены данные, чтогенотип интерлейкина 28В являетсянезависимым и наиболее достоверным фактором, влияющим на частоту раннего иустойчивого вирусологического ответа наПВТ(противовирусная терапия)среди другихфакторов прогноза.При этом полиморфизмы rs12979860 отвечают за получение ответа, аполиморфизмы rs8099917 тесно связаны с отсутствием ответа на ПВТ.На основании этого рекомендуется следующийалгоритм обследованияприподготовке клечению. Определение генотипа пациента по IL28B может изменить алгоритм принятия решения олечении путем изменения длительности, как стандартного курса терапии ПЕГ ИФН/РИБ, таки длительности тройной терапии ХГС. Оптимизация терапии позволит избежать многихдополнительных проблем при лечении пациентов с высокой вероятностьюположительного ответа при назначении терапии (избежатьдополнительных побочныхэффектов и дополнительных затрат на тройную терапию, с включениемингибиторовпротеазы – телапревира и боцепревира) Определение генотипа пациента по IL28B может изменить алгоритм принятия решения олечении путем изменения длительности, как стандартного курса терапии ПЕГ ИФН/РИБ, таки длительности тройной терапии ХГС. Оптимизация терапии позволит избежать многихдополнительных проблем при лечении пациентов с высокой вероятностьюположительного ответа при назначении терапии (избежатьдополнительных побочныхэффектов и дополнительных затрат на тройную терапию, с включениемингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира) Маркер связан с генетической резистентностью к вирусным инфекциям и эффективностью лечения хронического гепатита С препаратами рибавирин («Ребетол») и PEG-интерферон («ПегИнтрон»). Название генаIL28B OMIM - *607402 Локализация гена на хромосомеФункция генаГен IL28B кодирует белок интерферон-лямбда-3, который является лигандом цитокинового рецептора II класса. IL28B запускает JAK/STAT-сигнальный каскад, передающий информацию от внеклеточных полипептидных сигналов к промоторам генов-мишеней, блокируя синтез вирусных белков. Генетический маркер rs12979860Участок ДНК в регуляторной области гена IL28B, в котором происходит замена нуклеотида цитозин (С) на тимин (Т), обозначается как генетический маркер g.39738787C>T или rs12979860. Rs12979860 - обозначение однонуклеотидного полиморфизма по базе данных NCBI. Возможные генотипыЧастота встречаемости в популяцииЧастота встречаемости минорного (Т) аллеля в европейской популяции составляет 32 %. Ассоциация маркера с заболеваниямиМаркер связан с генетической резистентностью к вирусным инфекциям и эффективностью лечения хронического гепатита С препаратами рибавирин («Ребетол») и PEG-интерферон («ПегИнтрон»). Полиморфизм IL28B определяет как вероятность самопроизвольной элиминации вируса, так и ответ на противовирусную терапию. Анализ назначается: Перед началом терапии хронического гепатита С - прогнозирование ответа на лечение; При выборе тактики лечения хронического гепатита С. ОписаниеВирус гепатита С в основном передаётся через кровь. Им поражено около 3 % населения мира. Инфекция вызывает острый гепатит и характеризуется отсутствием достаточного иммунного ответа. В 50-80 % случаев он переходит в хроническую форму и приводит к циррозу печени и гепатоцеллюлярной карциноме. В настоящее время в качестве противовирусной терапии (ПВТ) гепатита С наиболее часто применяется сочетание двух препаратов - интерферона-альфа («PEG-интерферона») и рибавирина, что подтверждается международными исследованиями и клинической практикой. Основной задачей противовирусной терапии является профилактика цирроза печени и гепатокарциномы. Курс лечения хронического вирусного гепатита С продолжается 16-72 недели. При таком длительном применении данных препаратов развивается ряд выраженных побочных эффектов, так что в некоторых случаях лечение приходится прекратить. Эффективность противовирусной терапии зависит от многих факторов: генотипа вируса, исходной вирусной нагрузки, длительности инфицирования, обмена железа в организме, активности трансаминаз, избыточной массы тела, стеатоза печени, инсулинорезистентности, возраста, пола, алкогольной и наркотической зависимости, сопутствующих заболеваний, наличия выраженного фиброза. Достижение устойчивого вирусологического ответа, а также определение риска побочных реакций при приёме противовирусных препаратов очень важны для больного. В последнее время, чтобы оценить эффективность начальной или повторной ПВТ, используют индивидуальный генетический фактор - статус гена IL28B. Наибольшее диагностическое значение он имеет при лечении ХГС, вызванного 1-м генотипом вируса. При ХГС, вызванном 2-м и 3-м генотипами вируса, полиморфизм гена IL28B значим только для пациентов, у которых не достигнут быстрый вирусологический ответ (отсутствие РНК вируса гепатита С на 4-й неделе лечения). Распределение генотипов IL28B отличается в различных популяциях по всему миру и объясняет разную эффективность противовирусной терапии PEG-интерфероном и рибавирином в этнических группах. При выявлении у пациента генотипа СС наблюдается:
Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции. Для пациентов с генотипами С/Т и Т/Т характерно снижение вероятности ответа на ПВТ, т. е. низкая эффективность лечения. Интерпретация результатов
Результаты исследования интерпретируются врачом в комплексе с другими генетическими, анамнестическими, клиническими и лабораторными данными. Диагностическая значимостьПоскольку для гена IL28B известно несколько маркеров, расположенных в регуляторной области гена и определяющих характер его работы, исследование рекомендуется проводить в комплексе с маркером rs8099917. Важные замечанияДля данного маркера не существует понятия «норма» и «патология», т. к. исследуется полиморфизм гена. В диагностическом центре: взятие, либо самостоятельный сбор биоматериала осуществляется в диагностическом центре. Самостоятельно: сбор биоматериала осуществляется самим пациентом (моча, кал, мокрота и т.п.). Другой вариант - образцы биоматериала предоставляет пациенту врач (например, операционный материал, ликвор, биоптаты и т.п.). После получения образцов пациент может как самостоятельно доставить их в диагностический центр, так и вызвать мобильную службу на дом для передачи их в лабораторию. Последние материалы сайтаНаследственные«Прекрасный фонтан» на центральной площади НюрнбергаФотографии Антона Дергачева (кроме первой), комментарий Владимира Дергачева Идеальная супружеская пара на лебедях, которая вот-вот поцелуются. Фонтан «Супружеская или Брачная карусель» создан по мотивам немецкого средневекового поэта и композитора Ганс СимптомыКарта-схема комплексного обследованияЛогопедическое обследование детей с церебральным параличом Логопедическое обследование детей, страдающих церебральным параличом, строится на общем системном подходе, который опирается на представление о речи как о сложной функциональной системе, структ Методы диагностикиПять компотов из вишни на зимуАлександр Гущин За вкус не ручаюсь, а горячо будет:) Содержание Яркая, красивая ягода вишня содержит в себе огромное количество полезных микроэлементов и витаминов. Ее универсальность в кулинарии позволяет приготовить массу хороших, вкусных, уникаль Болевые синдромыГотовим изумительную пшенную кашу на молоке в мультиварке редмонд Как сварить пшенную кашу скороваркеНи одна кастрюля в мире не сварит пшенную кашу на молоке так вкусно, как это сделает мультиварка. И ни одна плита не справится с ее приготовлением так быстро, как мультиварка-скороварка. Простой и здоровый завтрак – сладкая пшенная каша на молоке, сдобрен СиндромыРыцарь монет таро значение в отношенияхНазвание: Рыцарь пентаклей, Рыцарь денариев, Рыцарь монет, Воин монет, Рыцарь бубен, Путешественник, Завоеватель Дел, Всадник, Кавалер, Полезный человек, Повелитель Земель Диких и Плодородных. Значение по Папюсу: Выгода, Прибыль, Польза, Интерес. Важное Методы леченияГороскоп на август телец девушкаТомный август у многих Тельцов станет благоприятным временем для развития личных отношений. В этот период у представителей данного знака Зодиака возникает возможность использовать на полную катушку свое природное обаяние для успеха в сердечных делах. Чтоб |