Трансплантация кишечной микробиоты для лечения заболеваний ЖКТ: открыт набор пациентов и доноров. Я пересаживаю кал людям

15.06.2019
Редкие невестки могут похвастаться, что у них ровные и дружеские отношения со свекровью. Обычно случается с точностью до наоборот

Поместить внутрь своего организма чужие фекалии - звучит крайне неприятно.

Но трансплантация фекальной микробиоты (фекальная трансплантация) оказалась ценным методом лечения многих заболеваний, таких как кишечные инфекции и дисбактериоз.

Особенно эффективна данная процедура при инфекциях, вызванных бактерией Clostridium difficile.

Среди всех видов трансплантации, которые существуют сегодня, трансплантация фекальной микробиоты - самая странная процедура. Но в то же время она решает многие проблемы, включая проблему резистентности некоторых патогенных микроорганизмов к антибиотикам.

Фекальная трансплантация - это разновидность терапии, известной под названием бактериотерапия, при которой врачи используют природные возможности полезных бактерий для борьбы с патогенными микроорганизмами. Бактериотерапия не только помогает лечить инфекции, но и восстанавливает естественный баланс микроорганизмов в нашем теле, в противоположность антибиотикам.

Сегодня этот удивительный метод лечения оброс разного рода слухами, страхами и мифами. Например, в выпусках новостей сообщалось, что у одной женщины развилось ожирение после трансплантации фекалий от донора с ожирением. Многие не понимают принципа работы данного метода, поэтому страхи - дело понятное.

Так как же на самом деле работает трансплантация фекальной микробиоты? В чем ее преимущества и недостатки? Как и где она возникла, и почему сегодня многие западные врачи активно пропагандируют этот метод лечения? Попробуем разобраться.

История фекальной трансплантации

Впервые случай фекальной трансплантации был описан в IV столетии нашей эры в Древнем Китае. В то время китайские врачи сообщали о применении чужих фекалий для лечения пищевых отравлений и диареи.

Намного позже, в XVI веке, авторитетный китайский фитотерапевт Ли Ши-чжэнь сообщал об эффективном лечении «болезней живота» с использованием «желтого супа» и «золотого сиропа», которые содержали свежие, сушеные или ферментированные фекалии.

В XVI веке в ветеринарной медицине существовала так называемая трансфаунация - процесс передачи микроорганизмов из пищеварительной системы здорового животного в пищеварительный тракт больного. Кстати, этот метод используется до сих пор.

Во время Второй мировой войны немецкие солдаты в Северной Африке сообщали, что бедуины в качестве лекарства от дизентерии использовали свежий верблюжий навоз, который у них считался очень эффективным средством.

Использование фекального материала для лечения болезней является очень древним методом, который, как считают некоторые ученые, применялся еще в доисторическую эпоху, просто подтверждений этого не осталось. Формально история фекальной трансплантации насчитывает уже более 1600 лет.

Принцип действия фекальной трансплантации

Современная трансплантация фекальной микробиоты (FMT) - это сложный и хорошо продуманный процесс. Он начинается с подбора здорового донора, чей фекальный материал будет использован для производства лекарства. После забора образца фекалии помещают в специальный раствор, очищают его и удаляют твердые частицы.

Далее используется один из множества путей введения фекального материала в кишечник пациента. Врач может сделать это с помощью обычной спринцовки, но чаще используют эндоскопию, колоноскопию или сигмоидоскопию. Считается, что все эти методы равноценны, поэтому американские врачи во многих случаях выбор оставляют за пациентом.

Считается, что естественные микроорганизмы в нашем кишечнике играют важную роль в поддержании здоровья. Доктор Хеннинг Герке (Henning Gerke), эксперт в области гастроэнтерологии и гепатологии из Университета Айовы, поясняет: «Эти организмы - бактерии, грибки, простейшие - начинают колонизировать кишечник человека еще в младенчестве. Они считаются важным элементом для тренировки иммунной системы и контроля над патогенами».

Таким образом, фекальная трансплантация должна восстановить разнообразие микрофлоры кишечника пациента и помочь иммунной системе победить болезнетворные микроорганизмы.

Доктор Герке пишет, что идея использования бактерий для контроля инфекций подтверждает правильность «теории излишней гигиены», согласно которой многие проблемы со здоровьем у современного человека - из-за чрезмерной чистоплотности и недостаточного контакта с микробами в раннем детстве.

«Мы знаем, к примеру, что определенные аутоиммунные заболевания менее распространены в тех странах, которые имеют низкие стандарты гигиены по сравнению с индустриальным миром», - заявляет доктор Герке.

Проблема Clostridium difficile

Сегодня фекальная трансплантация в США - это наиболее широко используемый метод лечения инфекций, вызванных Clostridium difficile. Такие инфекции возникают обычно на фоне нарушения микрофлоры кишечника. Основными симптомами инфекции Clostridium difficile являются боли в животе и диарея.

Инфекция часто возникает у пациентов, которые до этого длительное время принимали антибиотики для лечения другого заболевания. Хотя антибиотики могут быть эффективным средством для лечения ряда опасных бактериальных инфекций, они оказывают разрушительное влияние на микрофлору кишечника.

«Антибиотики спасают жизни, но каждый раз, когда мы даем их пациенту для эрадикации одного патогена, мы вместе с ним вымываем из организма полезные бактерии, которые поддерживают сложное и хрупкое равновесие в кишечнике», - говорит доктор Мария Олива-Хемкер (Maria Oliva-Hemker), детский гастроэнтеролог из Детского центра Джона Хопкинса в Балтиморе.

Инфекции, вызванные Clostridium difficile, в прошлом часто лечили все теми же антибиотиками, что доктор Герке называет «тушением пожара бензином».

Как поясняет доктор Сушитра Хуриган (Suchitra Hourigan), такой подход совершенно игнорирует первопричину заболевания.

«Когда мы назначаем антибиотики для лечения инфекции Clostridium difficile, мы разрушаем некоторые патогенные бактерии, но в то же время не решаем вторую часть проблемы. Мы ничего не делаем с потерей полезных бактерий, даже не пытаемся восстановить микробное равновесие в кишечнике. Очень часто через несколько недель диарея снова возвращается», - говорит доктор Хуриган.

Потеря «хороших» бактерий - это не единственная проблема при продолжительном лечении антибиотиками. Когда антибиотики не могут уничтожить полностью определенный штамм бактерий, есть вероятность появления резистентных организмов, которые не будут отвечать на лечение и станут настоящим бедствием для врачей.

Согласно данным авторов недавнего исследования, опубликованного в журнале Clinical Gastroenterology and Hepatology, бактерия Clostridium difficile в последние годы стала встречаться чаще, причем инфекции протекают тяжелее и чаще приводят к смерти пациентов. Кроме того, существующие методы терапии определенно теряют свою эффективность.

Фекальная трансплантация может стать эффективным решением всех этих проблем. Ведущие американские гастроэнтерологи сходятся во мнении, что эта процедура безопасная, недорогая и эффективная. В частности, при инфекции Clostridium difficile эффективность трансплантации фекального материала превышает 90%. Известная Клиника Мэйо даже раньше срока прервала свое клиническое испытание FMT, поскольку результаты лечения оказались «ошеломляюще успешными» и дальнейший анализ данных не требовался.

Законодательное регулирование процедуры в США

В Соединенных Штатах, где врачи проявляют особый интерес к процедуре фекальной трансплантации, возведено множество юридических барьеров на пути ее осуществления. Считается, что фекальная трансплантация - это малоизученный экспериментальный метод.

Администрация по контролю пищевых продуктов и лекарственных средств США (FDA) все еще не до конца одобрила FMT. Пока что фекальная трансплантация в этой стране разрешена только для пациентов с кишечными инфекциями, которые не отвечают на стандартную терапию, и только после получения информированного согласия.

«Такое отношение не приносит плодов. Мы хотим жестко регулировать вопрос, но тем самым мы стимулируем формирование черного рынка. Если вы что-то запрещаете, то люди попытаются делать это подпольно», - выразил свои опасения эксперт Марк Смит (Mark Smith) и интервью The New York Times.

В 2012 году Марк Смит и его коллеги открыли первый в США банк фекалий - OpenBiome. Этот банк призван сделать процедуру отбора материала и трансплантации быстрее, дешевле, безопаснее и доступнее для врачей и пациентов. Этот банк поставляет крупным больницам замороженные образцы фекального материала, которые те могут быстро использовать для FMT.

«Люди умирают, и это безумие, когда мы знаем решение и не принимаем его. Пациенты выполняют фекальную трансплантацию у себя в подвалах, не имея возможности провести скрининг и простерилизовать оборудование. Нам нужно немедленно решить этот вопрос и выпустить легальный коммерческий продукт на рынок», - говорит Смит.

Фонд фекальной трансплантации США утверждает, что сегодня в Америке только незначительный процент врачей имеет возможность проводить процедуру, и эти врачи просто перегружены работой. Кроме того, многие пациенты не могут найти здорового донора, и все из-за отсутствия решения регулятора - FDA.

Неизвестное будущее

В настоящее время есть множество неизвестных факторов, которые предстоит изучить. Исследователи пока не знают, какие именно бактерии из многообразной кишечной микрофлоры являются полезными, а какие могут быть даже опасными. Клиницисты не могут гарантировать, что фекальная трансплантация совершенно безопасна.

Мы уже упоминали о случае, когда у пациентки развилось ожирение после трансплантации фекального материала от донора с ожирением. Эксперты говорят, что в этой процедуре все еще остается элемент неопределенности, даже если такие случаи единичные и нуждаются во всестороннем изучении.

Доктор Герке акцентирует внимание, что пока фекальная трансплантация - это не стандартизированная процедура. По его словам, нужно провести еще очень много работы, прежде чем наука сможет предложить критерии оптимального донора фекалий, оптимальный метод приготовления материала и лучшие способы его введения в организм реципиента.

Фонд фекальной трансплантации утверждает, что случай с ожирением - это пока единственный задокументированный серьезный побочный эффект процедуры за все время ее применения - начиная с IV столетия и до наших дней. Рандомизированные контролируемые исследования в настоящее время только проводятся, и о их результатах говорить рано.

Ученые говорят, что фекальная трансплантация может успешно использоваться не только при инфекции Clostridium difficile, но и при других заболеваниях, которые прямо или косвенно связаны с нарушением равновесия кишечной микрофлоры. Сюда относят воспалительные заболевания кишечника, синдром раздраженного кишечника, сахарный диабет 2 типа и ожирение.

Некоторые опасения связаны с большой вариабельностью состава фекального материала. Чтобы решить эту проблему, уже сегодня несколько лабораторий трудятся над созданием синтетического фекального материала на основе строго определенных бактериальных культур. Такие препараты можно будет употреблять перорально в форме капсул.

«Менее чем через 10 лет мы сможем назначать приготовленные в лаборатории фекалии для восстановления микрофлоры кишечника при широком спектре заболеваний», - предсказывает доктор Олива-Хемкер.

Константин Моканов

Новости о том, что врачи решили лечить то или иное заболевание с помощью фекальных трансплантатов, появляются все чаще. Эта методика используется для борьбы с различными болезнями желудочно-кишечного тракта, а также заболеваниями, затрагивающими другие системы органов.

Так, в одном из последних исследований оказалось, что при лечении рецидивирующей диареи, вызванной бактериями Clostridium difficile, фекальная трансплантация оказалась эффективнее, чем антибиотики и плацебо. Поиск альтернативного способа борьбы с диареей начался после того, как антибиотики перестали помогать во многих случаях – это связано с увеличением частоты случаев возбудителя болезни к этим препаратам.

Это новый метод?

О возможности такого лечения в научном мире заговорили более полувека назад, но до недавнего времени какие-либо протоколы лечения и рандомизированные клинические исследования отсутствовали.

В настоящее время показано, что трансплантация кала может оказаться эффективной при лечении воспалительных и инфекционных заболеваний печени, ожирении, болезни Паркинсона, а также целиакии, болезни Крона и различных формах диареи. Существуют предположения, что методика может оказаться эффективной при борьбе с расстройствами .

Как это вообще работает?

При фекальной трансплантации пациенту вводится кал, взятый у здорового донора. Вместе с ним производится пересадка кишечной микробиоты – тех микроорганизмов, которые присутствуют в пищеварительной системе реципиента. После пересадки эти микроорганизмы начинают размножаться, заселяя кишечник донора, постепенно компенсируя дефицит тех или иных бактерий. В результате кишечный микробиом донора «перезагружается» и становится более разнообразным.

Как берут образцы для пересадки?

Человек, принявший решение стать донором, проходит тщательное обследование: он не должен быть носителем вирусных гепатитов, ВИЧ и патогенных бактерий, например, Clostridium difficile. Вместе с фекальной микробиотой реципиенту не должны передаться микроорганизмы, способные вызвать различные инфекции.

Как проходит пересадка?

Сейчас разработано несколько методик доставки донорского биоматериала в организм. В одних случаях используется колоноскопия и капсула с содержимым вводится через прямую кишку. В других применяется назогастральная интубация: капсулу доставляют через нос в желудок или малый кишечник. Наконец, еще один способ: таблетки, содержащие замороженные фекалии. Каждый из этих способов имеет свои преимущества и недостатки, но пациенты могут выбрать предпочтительный для них, взвесив все плюсы и минусы.

В мире существуют банки фекальных образцов, куда врачи и пациенты могут обратиться, столкнувшись со сложностями при поиске подходящего донора.

Это действительно помогает?

Трансплантация кала оказалась в 3 раза эффективнее, чем антибиотики, при лечении диареи, вызванной клостридиями. А вот при язвенном колите она помогает не столь успешно – в 2015 году продемонстрировать значимую разницу между пациентами из экспериментальной и контрольной групп не удалось.

Кроме того, то, насколько эффективной окажется терапия, зависит от особенностей самого пациента. Ученым пока не удалось выявить критерии, по которым можно определить, будет ли лечение успешным, но они предполагают, что свою роль могут играть бактериофаги и некоторые кишечные бактерии, присутствие которых снижает эффективность трансплантации.

В ФНКЦ ФМБА России открылась научно-исследовательская программа по лечению воспалительных заболеваний кишечника и антибиотик-ассоциированной диареи методом трансплантации кишечной (фекальной) микробиоты (ТФМ). ТФМ – новый вид лечения заболеваний, связанных с деятельностью бактерии Clostridium difficile, применяемый в случаях, когда другие методы лечения неэффективны.

Инфекция Clostridium difficile вызывает антибиотик-ассоциирован­ную диарею и обусловливает наиболее тяжелую её форму – псевдомембранозный колит. Это острое воспаление толстого кишечника, симптомами которого являются продолжительная диарея, боли в животе в сочетании с симптомами общей интоксикации.

Трансплантация кишечной микрофлоры подразумевает доставку фекальных масс от здорового человека в желудочно-кишечный тракт дру­гого человека с целью восстановления стабильного микробного сообщества в кишечнике. Наиболее распространенной является доставка через эндоскоп который проводится в толстую кишку до того места, где она соединяется с тонкой кишкой.

Назначение суспензии фекалий человека пациен­там с пищевыми отравлениями и тяжелой диа­реей было впервые описано еще в IV веке н. э. в Китае. В XVI веке китайский врач и фармаколог Ли Шичжэнь использовал раз­личные продукты из стула для лечения диареи, лихорадки, боли, рвоты и запора. В XVII веке этим методом лечили животных. Ренессанс произошел в ХХ веке, когда об использовании фекальных клизм у людей для лечения псевдомембранозного энтероколита сооб­щили в 1958 г.

На сегодняшний день утверждены клинические руководства по использованию ТФМ у пациентов с заболеваниями, связанными с деятельностью бактерии Clostridium difficile. Также ведутся исследования по использованию при неспецифическом язвенном колите, болезни Крона, сахарном диабете, избыточном весе.

Мы приглашаем здоровых лиц для участия в программе в качестве доноров кишечной микробиоты. Допущенные к донации лица и их родственники получат специальные условия при обследовании и лечении в ФНКЦ ФМБА России.

Как стать донором

1. Ответьте на три простых вопроса:

  • Ваш возраст - от 16 до 55 лет?
  • Индекс массы тела - 19-26?
  • На момент донации вы проживаете в Москве или Московской области?

Если вы ответили положительно на каждый вопрос, переходите к пункту 2.

2. Возьмите в регистратуре анкету () или скачайте её здесь. Ответьте на вопросы анкеты. Если на все вопросы анкеты Вы ответили отрицательно, отправьте ее по электронному адресу [email protected] .

3. Приходите на первое интервью. Интервьюирование происходит бесплатно.

4. При благоприятном результате интервью необходимо будет пройти осмотр врача, сдать ряд анализов и затем пройти второе интервьюирование.

5. Если состояние Вашего здоровья и результаты лабораторных анализов будут соответствовать показателям нормы, Вы будете допущены к прохождению карантинного периода.

Что такое карантинный период?

В течение 60 дней 5 раз в неделю необходимо будет сдавать образцы кишечного содержимого в лабораторию ЭнтерБиом; 1 раз в 7 дней будет выполняться забор крови. В течение карантинного периода не допускается перерыв более 2-х дней при сдаче образцов биоты. При нарушении графика визитов потребуется повторное интервьюирование и прохождение лабораторного обследования.

6. Через 60 дней произойдет третье интервьюирование, будут выполнены выборочные исследования образцов кишечного содержимого и крови. В случае положительного результата Вы допускаетесь к донации.

Условия для лиц, допущенных к донации кишечной биоты

Сдача кишечной биоты не реже 1 раза в день 5 дней в неделю. Через 60 дней донор должен пройти интервьюирование, лабораторную диагностику крови и кишечной биоты.

Столь серьезные требования к Донорам кишечной микробиоты определяются данными мировых клинических рекомендаций, результатами научных исследований, обеспечивают максимальную защиту пациентов, участвующих в программе лечения методом трансплантации кишечной микробиоты.

Лица, допущенные до донации кишечной микробиоты, получат специальные условия лечения и обследования в ФНКЦ ФМБА РОССИИ. Льготу можно использовать для члена семьи или родственника.

Американские учёные разработали инновационный метод лечения стойких к обычным антибиотикам кишечных инфекций путём фекальной трансплантации микроорганизмов.

Желудочно-кишечный тракт человеческого организма содержит тысячи полезных, необходимых для поддержания здоровья бактерий. Используемые при лечении многих болезней антибиотики разрушают внутри кишечника благотворную для «хороших» бактерий среду обитания. В поврежденной микрофлоре начинают процветать болезнетворные микроорганизмы. Одной из вредных для человека бактерий является Clostridium difficile. Она вызывает у людей инфекционный колит в тяжелой форме, сопровождающийся стойкой диареей, тошнотой и рвотой.

Как правило, для лечения псевдомембранозного колита применяются препараты ванкомицин и метронидазол, относящиеся к группе антибиотиков. Штаммы Clostridium difficile крайне слабо поддаются подобному лечению, поскольку являются весьма антибиотикоустойчивыми.

Из-за невозможности вылечить энтероколит консервативными методами врачам приходится идти на оперативное вмешательство и удалять пациентам участок кишечника, затронутый болезнью!

По данным медицинской статистики Соединенных Штатов Америки в 2012 году диагноз инфицирования бактерией Clostridium difficile был поставлен 347 тысячам человек. Из них умерли от данного заболевания почти 30 000 пациентов.

Фекальные трансплантации под названием «жёлтый суп» делались специалистами китайской народной медицины ещё в 4-ом веке. В разных регионах мира издавна применяют подобную практику для укрепления иммунной системы новорожденных. С этой целью в толстую кишку ребенка помещается небольшое количество кала его матери. Попавшие в ЖКТ малыша полезные микробы тотчас начинают там расселяться, создавая надежный защитный барьер для инфекции.


Американские учёные работают над проблемой фекальной трансплантации с 50-ых годов прошлого столетия.
Множество экспериментов за эти годы было поставлено ими на животных. Наконец, в 2012 году, настал момент, когда в экспериментально проводимом медиками лечении калом приняли участие сорок девять человек.

Исследование происходило на базе клиники имени Генри Форда. Все пациенты страдали от тяжелой формы энтероколита, сопровождавшейся хронической диареей. Американскими специалистами было установлено, что болезнь вызвана именно бактерией C.difficile.

Всем пациентам-участникам проекта с помощью эндоскопа или во время процедуры колоноскопии была проведена трансплантация фекальной микробиоты. Кал был взят у здоровых людей, выступивших донорами. В толстую кишку каждого больного доктора вводили тёплую воду с растворенными в ней фекалиями в количестве 30-50 грамм.

У 90 процентов человек, прошедших данную процедуру, уже через пару часов после неё было зафиксировано явное улучшение самочувствия — у них появился аппетит. Спустя семь дней врачи констатировали полное выздоровление этой группы пациентов. После проведения пересадки кала доктора наблюдали за участниками эксперимента ещё в течение трёх месяцев и отметили отсутствие у них каких-либо побочных эффектов или осложнений примененного метода.

Вслед за американцами практическими исследованиями в области трансплантации кала занялись специалисты Амстердамского Университета. Вначале они привлекли к эксперименту 120 добровольцев. Затем, оценив состояние здоровья каждого пациента, оставили для проведения нескольких процедур пересадки кала только шестнадцать человек. Тринадцать из участников эксперимента стали полностью здоровы после первой же процедуры. Вторая процедура вернула здоровье еще двоим.

Параллельно с этим испытанием 26 пациентов с аналогичным заболеванием получали лечение ванкомицином. Выздоровели только семеро из них. Остальные, не имея в лечении положительной динамики, обратились к врачам с просьбой включить их в число лиц, которым делалась пересадка фекальных бактерий. Доктора пошли больным навстречу и сделали им пересадку кала. Некоторые из этих пациентов выздоровели уже после одной процедуры, другие — после двух.

Положительный опыт амстердамских коллег побудил медиков США создать в текущем году банк фекальных образцов, предназначенный для излечения людей, страдающих тяжелой формой рецидивирующей диареи!

Ученые Австралии в ходе экспериментальной терапии установили связь между применением фекальных донорских бактерий и одновременным уменьшением у пациентов запоров и симптомов болезни Паркинсона. Исследователи предполагают, что при повреждении микрофлоры в кровь из неё проникают некоторые антигены. На таком фоне у человека быстро развивается паркинсонизм. Также это способствует развитию ряда аутоиммунных заболеваний, ревматоидного артрита, синдрома хронической усталости, рассеянного склероза.

Существует гипотеза, что пересадка кала способствует снижению веса и может рассматриваться как один из эффективных способов похудания!

Изначально трансплантация фекалий осуществлялась через клизму, колоноскоп или питательный зонд. Но такие способы доставки в организм больного здоровой микрофлоры малокомфортны и могут повлечь за собой травмирование желудочно-кишечного тракта.

В связи с этим учёные Америки разработали новый метод пересадки фекальной микробиоты – через рот. Для этого ими были созданы специальные капсулы для перорального приёма. В них разработчики метода поместили натуральный замороженный донорский кал, имеющий в составе жизнетворные бактерии и свободный от любых аллергенов.

Сами капсулы делались из вещества, устойчивого к кислотной желудочной среде.

В первом исследовательском опыте участвовали двадцать пациентов разной возрастной категории. В составе группы испытуемых были дети в возрасте 11 лет, были и больные, которым за восемьдесят. Каждый участник пилотного исследования выпивал ежедневно по 15 фекальных капсул.

После двухдневного приема нового лекарства у 14 человек полностью исчезли все симптомы заболевания. Повторение курса фекалотерапии для остальных шести участников группы принесло положительные результаты. Интересно, что состояние здоровья этих шести человек было значительно хуже, чем у остальных.

Отрицательных побочных явлений при проведении терапевтического эксперимента не выявлено.

Американские специалисты, окрыленные первым успехом, нацелены теперь на более полновесное и крупномасштабное исследование, целью которого они видят для себя подтверждение первоначальных выводов о действенности и безопасности нового, перорального способа пересадки кала.

Как меняет твою жизнь, оптику и чувство нормы работа в лаборатории, где уже много лет изучают бактерии и вирусы, обитающие исключительно в испражнениях? Что такое «микробная тёмная материя», как она связана с облысением и медвежьей слюной - и другие детали неожиданного ландшафта, через который пролегает передовая микробиологического знания. Самиздат публикует анонимный рассказ специалиста по биоинформатике из одного российского НИИ.

Говорят, когда-то в нашей лаборатории был заведующий. Он всех принуждал к ведению ежедневного блога, запрещал микроволновки и медитировал в специально отведённой для этого комнате. Я его никогда не видела. Когда пришла, всё уже так и было: заведующий становился мифом, а лаборатория постепенно впадала в анархо-коммунистическое блаженство.

Коллегам из других лабораторий и институтов часто бывает сложно поверить, что нам удаётся жить и выживать без заведующего, поэтому мы придумали воображаемого заведующего и расклеиваем по этажу приказы от его имени за подписью «зав. лабораторией биоинформатики к.б.н. А. П. Жиром».

Функцию неформальных лидеров выполняют Саня, Саня и Саня. Поскольку в лаборатории работают ещё двое Сань, было решено, что вот были митьки, а мы все будем саньки. Саньки-биоинформатики из Института *****.

В остальном НИИ нас считают немного панками. Раньше мы ходили курить трубку во внутренний дворик института. Неподалёку была помойка, куда из института выкидывали всякие лабораторные ништяки: огромные деревянные ящики из-под секвенатора, доисторические приборы, цветные стёклышки и провода, советскую посуду. Мы с энтузиазмом в этом копались и поднимали самые интересные артефакты к себе на пятый этаж. Это всё прекрасно было видно из окон других лабораторий. Кажется, последними мы приволокли кленовые пни, оставленные рабочими во дворике. Было тяжело, но теперь нам есть на чём сидеть.

Темноватая магия

Это не единственный - подчёркиваю: далеко не единственный! - аспект нашей деятельности, но мы действительно пересаживаем кал. Вообще его в нашем НИИ изучают во всех проявлениях: размазывают, замораживают и секвенируют. А также пересаживают от человека к человеку.

Делается это либо:
а) гастроскопом в жидком виде через рот;
б) колоноскопом с другой стороны;
в) более приятно, но менее эффективно - в кристаллическом виде в капсулах. Запаха совсем нет, и с виду похоже на карамель.


Процедура эта используется для лечения тяжёлых кишечных болезней, и мы не сами её придумали. Эффект настолько волшебный, что за границей её начинают использовать как панацею от всего. Видела статьи, как более-менее успешно таким образом лечили аутизм и облысение - и бог знает что ещё, наверное, пытались.

Как бы это ни прозвучало, между аутизмом и бактериями в кишечнике действительно есть связь, хоть и не до конца понимаемая пока. Да и облысение имеется в виду не простое, а аутоиммунное: это когда лимфоциты решают, что волосяные луковицы - вредные посторонние объекты, которые подлежат уничтожению. Бактерии из чужого тела, видимо, вправляют мозги слегка поехавшей иммунной системе, напоминая, где свои, а где чужие.

Это всё работает как магия, потому что никто на свете не может доподлинно разобраться, как и за счёт чего. Собственно, наша задача в том и состоит, чтобы эту загадку разрешить, иначе врачи справились бы и без нас. Мы секвенируем и смотрим, какие микробы были в кишечнике до, а какие появились после пересадки кала; какие пришли от донора, а какие появились, казалось бы, из ниоткуда. И нам до сих пор ни черта не понятно.

Неизвестная бактерия № 6538

Дело в том, что в микробиологии есть своя так называемая микробная тёмная материя. Это бактерии и вирусы, которых никто никогда не видел, но которые реально живут и у человека в жопе, и у кошки, и под камнем в пустыне, и в кислотных шахтах, и в океане, и чего-то там все они делают. Но что именно - непонятно, потому что они по разным причинам не поддаются культивации в лабораторных условиях. Это не вполне очевидно, но далеко не все бактерии могут выжить и размножиться в чашке Петри, а значит, привычным методом изучать и описывать их почти невозможно.

Пока учёные совсем недавно не додумались просто тыкать пипеткой куда попало и секвенировать всё подряд, о масштабе этой проблемы даже и не было известно как следует. Это особенно верно в случае вирусов, так как бактерий более или менее описали, пусть и в стиле «неизвестная бактерия номер 6538, которую мы нашли в муравейнике». А в случае с вирусами мы дай бог если с пятью процентами знакомы. И вот единственное, что мы видим, - это как от донора к пациенту иногда переходит какая-то Неизвестная Штука и остаётся там. Что именно это за бактерии или вирусы, мы не знаем.


Давняя тема работы нашей лаборатории - выяснять, связано ли нечто (например, какая-то болезнь) с составом бактерий в кишечнике. Иные зарубежные коллеги уже без стеснений связали их с настроением и темпераментом , но и у нас не сдаются и ищут новые закономерности.

Помимо кишечной микрофлоры, я изучаю микрофлору вагинальную. И у нас как-то сами собой зарождались шутки о том, что её тоже пора пересаживать - для профилактики и общего оздоровления. Не так давно я случайно увидела такую работу: люди пересаживали микробиоту влагалища от морских свинок к морским свинкам и сообщали о замечательном эффекте и перспективности перенесения этого опыта и на человека.

На днях мне пришла в голову идея посмотреть, как изменяются бактерии при разложении трупа. Мысль эта привела в крайнее воодушевление: я озвучивала её на кухне, стоя на том самом пне, что мы притащили с помойки, и размахивала руками. Вечером того же дня выяснилось, что это уже сделали, но совсем недавно, и опубликовали про результаты эксперимента статью в Science .

Ликующая микробиота

Я донор. Даже значусь как «донор номер один». Не знаю, по порядку или по важности, но лестно. Потому как я охренительно здоровый человек, и материал мой якобы ценнейший и уже спас с десяток пациентов. Своеобразные ощущения принёс опыт одновременного «донорства» с мальчиком: находиться фактически в одной комнате и получать комплименты медсестёр и - о ужас! - ассистирующих коллег по поводу качества «материала». Сначала хотелось провалиться сквозь землю, но потом ничего, привыкла.

В этом году я, однако, занялась вегетарианством на грани сыроедения - отчасти для поиска новых ощущений в воздержании, отчасти из экспериментаторского азарта: как же изменятся мои бактерии? Стану ли я лучшим донором? Сверхдонором? Может быть, я заполучу сверхмикробиоту? Когда пришли анализы, меня вкрадчиво спросили, что случилось в моей жизни, потому что к донорству я была более не годна. Пообещав больше так не делать, я перешла на обычную диету, но тщетно: материал по-прежнему содержит условно-патогенные бактерии. Мой случай обсуждали недавно на конференции - на заседании по пересадке кала. Другие исследователи делились опытом: у них с вегетарианцами тоже выходило не очень, поэтому постановили их в доноры больше не брать.

Последние материалы сайта